При выявлении налоговым органом противоречий, несоответствий между сведениями об операциях, содержащимися в налоговых декларациях по НДС у разных налогоплательщиков или в журналах учета полученных и выставленных счетов-фактур, инспекция направляет налогоплательщику требование о представлении пояснений. К требованию прилагают перечень операций, по которым установлены расхождения. Чтобы налогоплательщику было легче определить причины расхождений, по каждой записи указывается код возможной ошибки.

Разъяснено, что после получения требования от налогового органа в электронной форме налогоплательщик обязан, в первую очередь, передать налоговому органу квитанцию о приеме этого требования в течение шести дней со дня его отправки налоговым органом. Далее, при выявлении в представленной декларации по НДС ошибки, приводящей к занижению суммы налога к уплате, необходимо представить уточненную декларацию с корректными сведениями. Если ошибка в декларации не повлияла на сумму НДС, надо направить пояснения с указанием корректных данных, а также рекомендуется представить уточненную декларацию. Если же ошибки в декларации вообще не выявлены, об этом необходимо уведомить налоговый орган путем представления пояснений. При направлении пояснений можно дополнительно представить документы, подтверждающие достоверность данных, внесенных в декларацию.